Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MFAP3P55082 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MFAP3P55082 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MFAP3P55082 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MFAP3P55082 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MFAP3P55082 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms