Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms