Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LUMP51884 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LUMP51884 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LUMP51884 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LUMP51884 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LUMP51884 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LUMP51884 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LUMP51884 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LUMP51884 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LUMP51884 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LUMP51884 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LUMP51884 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LUMP51884 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LUMP51884 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LUMP51884 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LUMP51884 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LUMP51884 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LUMP51884 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LUMP51884 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LUMP51884 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LUMP51884 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LUMP51884 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LUMP51884 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LUMP51884 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LUMP51884 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LUMP51884 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LUMP51884 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LUMP51884 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LUMP51884 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LUMP51884 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LUMP51884 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LUMP51884 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LUMP51884 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LUMP51884 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LUMP51884 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LUMP51884 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LUMP51884 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LUMP51884 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LUMP51884 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LUMP51884 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LUMP51884 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LUMP51884 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LUMP51884 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LUMP51884 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LUMP51884 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LUMP51884 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LUMP51884 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LUMP51884 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LUMP51884 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LUMP51884 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LUMP51884 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LUMP51884 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LUMP51884 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LUMP51884 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LUMP51884 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LUMP51884 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LUMP51884 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LUMP51884 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LUMP51884 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LUMP51884 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LUMP51884 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LUMP51884 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms