Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLCN4P51793 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN4P51793 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN4P51793 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLCN4P51793 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN4P51793 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN4P51793 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN4P51793 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN4P51793 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN4P51793 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN4P51793 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN4P51793 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN4P51793 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLCN4P51793 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN4P51793 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN4P51793 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN4P51793 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLCN4P51793 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN4P51793 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN4P51793 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLCN4P51793 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms