Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORCP51449 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORCP51449 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORCP51449 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORCP51449 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORCP51449 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORCP51449 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORCP51449 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORCP51449 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORCP51449 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORCP51449 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORCP51449 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORCP51449 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORCP51449 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RORCP51449 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORCP51449 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORCP51449 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORCP51449 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORCP51449 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORCP51449 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORCP51449 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORCP51449 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORCP51449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORCP51449 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORCP51449 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RORCP51449 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RORCP51449 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORCP51449 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORCP51449 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORCP51449 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORCP51449 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORCP51449 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORCP51449 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORCP51449 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORCP51449 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORCP51449 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORCP51449 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORCP51449 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORCP51449 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORCP51449 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORCP51449 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORCP51449 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORCP51449 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORCP51449 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORCP51449 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORCP51449 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORCP51449 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORCP51449 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORCP51449 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORCP51449 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORCP51449 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORCP51449 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORCP51449 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORCP51449 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORCP51449 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORCP51449 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORCP51449 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RORCP51449 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORCP51449 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RORCP51449 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORCP51449 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORCP51449 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORCP51449 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RORCP51449 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORCP51449 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORCP51449 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RORCP51449 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RORCP51449 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RORCP51449 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms