Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBP50607 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBP50607 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBP50607 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBP50607 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBP50607 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBP50607 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBP50607 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBP50607 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBP50607 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBP50607 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBP50607 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBP50607 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBP50607 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBP50607 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBP50607 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBP50607 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBP50607 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBP50607 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBP50607 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBP50607 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBP50607 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBP50607 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBP50607 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBP50607 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBP50607 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBP50607 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBP50607 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBP50607 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBP50607 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBP50607 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBP50607 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBP50607 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBP50607 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBP50607 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBP50607 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBP50607 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBP50607 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBP50607 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBP50607 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBP50607 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBP50607 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBP50607 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBP50607 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBP50607 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBP50607 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBP50607 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBP50607 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBP50607 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBP50607 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBP50607 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBP50607 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBP50607 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBP50607 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBP50607 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBP50607 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBP50607 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBP50607 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBP50607 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBP50607 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBP50607 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBP50607 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBP50607 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBP50607 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBP50607 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBP50607 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms