Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERFP50548 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERFP50548 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERFP50548 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERFP50548 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERFP50548 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERFP50548 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERFP50548 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERFP50548 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERFP50548 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERFP50548 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERFP50548 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERFP50548 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERFP50548 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERFP50548 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERFP50548 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERFP50548 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERFP50548 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERFP50548 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERFP50548 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERFP50548 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERFP50548 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERFP50548 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERFP50548 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERFP50548 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERFP50548 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERFP50548 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERFP50548 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERFP50548 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERFP50548 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERFP50548 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERFP50548 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERFP50548 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERFP50548 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERFP50548 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERFP50548 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERFP50548 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERFP50548 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERFP50548 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERFP50548 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERFP50548 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERFP50548 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERFP50548 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERFP50548 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERFP50548 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERFP50548 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERFP50548 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERFP50548 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERFP50548 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERFP50548 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERFP50548 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERFP50548 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERFP50548 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERFP50548 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERFP50548 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERFP50548 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERFP50548 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERFP50548 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERFP50548 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERFP50548 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERFP50548 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERFP50548 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERFP50548 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERFP50548 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERFP50548 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERFP50548 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERFP50548 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERFP50548 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERFP50548 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms