Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HNMTP50135 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HNMTP50135 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNMTP50135 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNMTP50135 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNMTP50135 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNMTP50135 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNMTP50135 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNMTP50135 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNMTP50135 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNMTP50135 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HNMTP50135 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNMTP50135 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HNMTP50135 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HNMTP50135 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNMTP50135 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNMTP50135 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNMTP50135 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNMTP50135 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HNMTP50135 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNMTP50135 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNMTP50135 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNMTP50135 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNMTP50135 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNMTP50135 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNMTP50135 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HNMTP50135 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNMTP50135 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNMTP50135 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNMTP50135 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNMTP50135 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNMTP50135 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNMTP50135 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNMTP50135 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNMTP50135 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HNMTP50135 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HNMTP50135 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HNMTP50135 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HNMTP50135 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HNMTP50135 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNMTP50135 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNMTP50135 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HNMTP50135 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HNMTP50135 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNMTP50135 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNMTP50135 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNMTP50135 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNMTP50135 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNMTP50135 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNMTP50135 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNMTP50135 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNMTP50135 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNMTP50135 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNMTP50135 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNMTP50135 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNMTP50135 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNMTP50135 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HNMTP50135 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNMTP50135 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNMTP50135 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNMTP50135 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNMTP50135 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HNMTP50135 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNMTP50135 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNMTP50135 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNMTP50135 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HNMTP50135 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNMTP50135 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNMTP50135 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HNMTP50135 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HNMTP50135 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNMTP50135 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNMTP50135 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNMTP50135 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms