Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSNK1EP49674 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSNK1EP49674 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSNK1EP49674 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1EP49674 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSNK1EP49674 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1EP49674 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms