Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN7P41732 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSPAN7P41732 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN7P41732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN7P41732 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN7P41732 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms