Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ATP7BP35670 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATP7BP35670 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7BP35670 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7BP35670 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ATP7BP35670 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP7BP35670 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7BP35670 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms