Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP6P35125 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP6P35125 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP6P35125 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
USP6P35125 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
USP6P35125 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
USP6P35125 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
USP6P35125 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP6P35125 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP6P35125 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP6P35125 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
USP6P35125 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP6P35125 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP6P35125 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
USP6P35125 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
USP6P35125 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
USP6P35125 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
USP6P35125 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP6P35125 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
USP6P35125 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
USP6P35125 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
USP6P35125 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP6P35125 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP6P35125 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP6P35125 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP6P35125 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP6P35125 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP6P35125 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP6P35125 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
USP6P35125 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP6P35125 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP6P35125 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP6P35125 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP6P35125 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP6P35125 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP6P35125 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP6P35125 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
USP6P35125 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
USP6P35125 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
USP6P35125 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP6P35125 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP6P35125 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
USP6P35125 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
USP6P35125 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP6P35125 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP6P35125 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
USP6P35125 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP6P35125 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
USP6P35125 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
USP6P35125 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
USP6P35125 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP6P35125 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP6P35125 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP6P35125 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP6P35125 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP6P35125 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
USP6P35125 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
USP6P35125 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
USP6P35125 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
USP6P35125 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
USP6P35125 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
USP6P35125 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
USP6P35125 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
USP6P35125 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
USP6P35125 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
USP6P35125 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP6P35125 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP6P35125 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP6P35125 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP6P35125 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP6P35125 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP6P35125 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP6P35125 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP6P35125 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
USP6P35125 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
USP6P35125 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP6P35125 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP6P35125 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP6P35125 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP6P35125 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
USP6P35125 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP6P35125 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP6P35125 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP6P35125 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
USP6P35125 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP6P35125 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP6P35125 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP6P35125 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP6P35125 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP6P35125 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP6P35125 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms