Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDAP32320 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDAP32320 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDAP32320 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDAP32320 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDAP32320 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDAP32320 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDAP32320 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDAP32320 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDAP32320 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDAP32320 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDAP32320 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDAP32320 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDAP32320 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDAP32320 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDAP32320 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDAP32320 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDAP32320 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDAP32320 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDAP32320 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDAP32320 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDAP32320 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDAP32320 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDAP32320 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDAP32320 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDAP32320 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDAP32320 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDAP32320 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDAP32320 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDAP32320 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDAP32320 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDAP32320 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDAP32320 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDAP32320 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDAP32320 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDAP32320 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDAP32320 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDAP32320 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDAP32320 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDAP32320 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDAP32320 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDAP32320 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDAP32320 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDAP32320 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDAP32320 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDAP32320 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDAP32320 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDAP32320 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDAP32320 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDAP32320 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDAP32320 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDAP32320 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDAP32320 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDAP32320 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDAP32320 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDAP32320 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDAP32320 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDAP32320 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDAP32320 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDAP32320 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDAP32320 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDAP32320 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDAP32320 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDAP32320 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDAP32320 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDAP32320 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDAP32320 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDAP32320 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDAP32320 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDAP32320 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDAP32320 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDAP32320 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDAP32320 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDAP32320 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDAP32320 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDAP32320 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDAP32320 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDAP32320 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDAP32320 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDAP32320 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDAP32320 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDAP32320 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDAP32320 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDAP32320 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDAP32320 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDAP32320 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDAP32320 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms