Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3AP31941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3AP31941 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3AP31941 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3AP31941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3AP31941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms