Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP1P29466 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP1P29466 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP1P29466 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP1P29466 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP1P29466 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP1P29466 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP1P29466 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP1P29466 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP1P29466 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP1P29466 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP1P29466 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP1P29466 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP1P29466 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP1P29466 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP1P29466 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP1P29466 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP1P29466 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP1P29466 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASP1P29466 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP1P29466 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP1P29466 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP1P29466 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP1P29466 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP1P29466 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP1P29466 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP1P29466 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP1P29466 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP1P29466 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP1P29466 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP1P29466 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP1P29466 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP1P29466 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP1P29466 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP1P29466 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP1P29466 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP1P29466 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP1P29466 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP1P29466 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP1P29466 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP1P29466 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP1P29466 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP1P29466 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP1P29466 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP1P29466 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP1P29466 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP1P29466 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP1P29466 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP1P29466 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP1P29466 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP1P29466 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP1P29466 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP1P29466 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP1P29466 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP1P29466 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP1P29466 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP1P29466 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP1P29466 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP1P29466 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP1P29466 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP1P29466 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP1P29466 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP1P29466 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP1P29466 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP1P29466 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP1P29466 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP1P29466 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP1P29466 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP1P29466 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP1P29466 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP1P29466 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP1P29466 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP1P29466 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP1P29466 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP1P29466 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP1P29466 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP1P29466 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP1P29466 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms