Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHC1P29353 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHC1P29353 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHC1P29353 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHC1P29353 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHC1P29353 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHC1P29353 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHC1P29353 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHC1P29353 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHC1P29353 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHC1P29353 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHC1P29353 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHC1P29353 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHC1P29353 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHC1P29353 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHC1P29353 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC1P29353 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHC1P29353 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC1P29353 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC1P29353 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHC1P29353 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC1P29353 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHC1P29353 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHC1P29353 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHC1P29353 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC1P29353 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC1P29353 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC1P29353 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHC1P29353 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC1P29353 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC1P29353 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC1P29353 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHC1P29353 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHC1P29353 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHC1P29353 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC1P29353 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC1P29353 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHC1P29353 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC1P29353 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHC1P29353 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC1P29353 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC1P29353 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC1P29353 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHC1P29353 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC1P29353 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC1P29353 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC1P29353 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC1P29353 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC1P29353 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC1P29353 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC1P29353 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC1P29353 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC1P29353 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC1P29353 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC1P29353 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC1P29353 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC1P29353 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC1P29353 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC1P29353 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC1P29353 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC1P29353 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC1P29353 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC1P29353 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC1P29353 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC1P29353 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC1P29353 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC1P29353 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC1P29353 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC1P29353 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC1P29353 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms