Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
GTF2E1P29083 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GTF2E1P29083 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GTF2E1P29083 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GTF2E1P29083 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GTF2E1P29083 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GTF2E1P29083 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GTF2E1P29083 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms