Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXP28300 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LOXP28300 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LOXP28300 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXP28300 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXP28300 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LOXP28300 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LOXP28300 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXP28300 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXP28300 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXP28300 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LOXP28300 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LOXP28300 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXP28300 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXP28300 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LOXP28300 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXP28300 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LOXP28300 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXP28300 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXP28300 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXP28300 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LOXP28300 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXP28300 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXP28300 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXP28300 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXP28300 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LOXP28300 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXP28300 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXP28300 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXP28300 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXP28300 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXP28300 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXP28300 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXP28300 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXP28300 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXP28300 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXP28300 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXP28300 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXP28300 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXP28300 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXP28300 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXP28300 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXP28300 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXP28300 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXP28300 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXP28300 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXP28300 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXP28300 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOXP28300 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXP28300 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXP28300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXP28300 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXP28300 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXP28300 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXP28300 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXP28300 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXP28300 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXP28300 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXP28300 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXP28300 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXP28300 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXP28300 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXP28300 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXP28300 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms