Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MGAT1P26572 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGAT1P26572 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MGAT1P26572 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGAT1P26572 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MGAT1P26572 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms