Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTFP26441 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTFP26441 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTFP26441 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTFP26441 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTFP26441 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTFP26441 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTFP26441 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTFP26441 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTFP26441 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTFP26441 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTFP26441 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTFP26441 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTFP26441 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTFP26441 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTFP26441 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTFP26441 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTFP26441 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTFP26441 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNTFP26441 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTFP26441 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTFP26441 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTFP26441 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTFP26441 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTFP26441 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTFP26441 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTFP26441 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTFP26441 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTFP26441 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTFP26441 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTFP26441 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTFP26441 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTFP26441 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTFP26441 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTFP26441 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTFP26441 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTFP26441 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTFP26441 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTFP26441 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTFP26441 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTFP26441 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTFP26441 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTFP26441 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTFP26441 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTFP26441 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTFP26441 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTFP26441 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTFP26441 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTFP26441 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTFP26441 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTFP26441 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTFP26441 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTFP26441 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTFP26441 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTFP26441 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTFP26441 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTFP26441 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTFP26441 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTFP26441 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTFP26441 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTFP26441 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTFP26441 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTFP26441 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTFP26441 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTFP26441 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTFP26441 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTFP26441 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTFP26441 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTFP26441 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTFP26441 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms