Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A2P23975 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A2P23975 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A2P23975 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC6A2P23975 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A2P23975 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms