Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCEA1P23193 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCEA1P23193 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCEA1P23193 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms