Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NME2P22392 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME2P22392 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME2P22392 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P22392 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P22392 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P22392 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P22392 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P22392 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P22392 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P22392 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME2P22392 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P22392 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P22392 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P22392 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P22392 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME2P22392 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NME2P22392 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME2P22392 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME2P22392 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P22392 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P22392 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P22392 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P22392 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P22392 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P22392 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P22392 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P22392 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME2P22392 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NME2P22392 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME2P22392 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME2P22392 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME2P22392 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P22392 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P22392 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P22392 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME2P22392 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME2P22392 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME2P22392 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME2P22392 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P22392 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P22392 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P22392 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME2P22392 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME2P22392 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P22392 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P22392 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P22392 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P22392 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P22392 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P22392 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P22392 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P22392 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P22392 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P22392 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME2P22392 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME2P22392 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME2P22392 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME2P22392 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME2P22392 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME2P22392 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME2P22392 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P22392 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P22392 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P22392 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P22392 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME2P22392 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME2P22392 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NME2P22392 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P22392 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P22392 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P22392 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P22392 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P22392 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P22392 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P22392 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P22392 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P22392 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P22392 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P22392 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms