Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSR1P21757 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSR1P21757 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSR1P21757 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSR1P21757 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSR1P21757 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSR1P21757 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSR1P21757 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSR1P21757 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSR1P21757 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSR1P21757 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSR1P21757 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSR1P21757 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSR1P21757 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSR1P21757 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSR1P21757 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSR1P21757 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSR1P21757 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSR1P21757 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSR1P21757 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSR1P21757 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSR1P21757 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSR1P21757 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSR1P21757 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSR1P21757 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSR1P21757 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSR1P21757 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSR1P21757 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSR1P21757 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSR1P21757 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSR1P21757 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSR1P21757 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSR1P21757 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSR1P21757 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSR1P21757 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSR1P21757 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSR1P21757 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSR1P21757 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSR1P21757 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSR1P21757 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSR1P21757 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSR1P21757 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSR1P21757 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSR1P21757 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSR1P21757 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSR1P21757 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSR1P21757 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSR1P21757 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSR1P21757 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSR1P21757 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSR1P21757 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSR1P21757 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSR1P21757 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSR1P21757 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSR1P21757 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSR1P21757 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSR1P21757 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSR1P21757 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSR1P21757 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSR1P21757 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSR1P21757 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSR1P21757 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSR1P21757 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSR1P21757 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSR1P21757 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSR1P21757 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSR1P21757 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSR1P21757 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSR1P21757 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSR1P21757 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSR1P21757 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSR1P21757 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSR1P21757 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSR1P21757 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSR1P21757 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSR1P21757 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSR1P21757 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSR1P21757 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSR1P21757 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1392.3 ms