Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF1P18846 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF1P18846 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF1P18846 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF1P18846 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF1P18846 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF1P18846 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF1P18846 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF1P18846 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF1P18846 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF1P18846 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF1P18846 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF1P18846 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF1P18846 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF1P18846 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF1P18846 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF1P18846 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF1P18846 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF1P18846 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF1P18846 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF1P18846 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF1P18846 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF1P18846 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF1P18846 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF1P18846 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF1P18846 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF1P18846 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF1P18846 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF1P18846 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF1P18846 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF1P18846 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF1P18846 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF1P18846 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF1P18846 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF1P18846 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF1P18846 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF1P18846 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF1P18846 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF1P18846 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF1P18846 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF1P18846 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF1P18846 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF1P18846 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF1P18846 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF1P18846 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF1P18846 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF1P18846 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF1P18846 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF1P18846 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF1P18846 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF1P18846 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF1P18846 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF1P18846 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF1P18846 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF1P18846 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF1P18846 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF1P18846 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF1P18846 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF1P18846 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF1P18846 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF1P18846 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF1P18846 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF1P18846 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF1P18846 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF1P18846 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF1P18846 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF1P18846 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF1P18846 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF1P18846 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF1P18846 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF1P18846 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF1P18846 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF1P18846 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF1P18846 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF1P18846 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms