Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF44P15621 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF44P15621 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF44P15621 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF44P15621 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms