Protein–RNA interactions for Protein: P12757

SKIL, Ski-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKILP12757 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKILP12757 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKILP12757 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKILP12757 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKILP12757 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKILP12757 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKILP12757 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKILP12757 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKILP12757 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKILP12757 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKILP12757 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKILP12757 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKILP12757 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKILP12757 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKILP12757 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKILP12757 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKILP12757 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKILP12757 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKILP12757 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKILP12757 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKILP12757 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKILP12757 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKILP12757 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKILP12757 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKILP12757 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKILP12757 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKILP12757 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKILP12757 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKILP12757 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKILP12757 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKILP12757 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKILP12757 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKILP12757 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKILP12757 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKILP12757 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKILP12757 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKILP12757 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKILP12757 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKILP12757 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKILP12757 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKILP12757 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKILP12757 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKILP12757 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKILP12757 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKILP12757 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKILP12757 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKILP12757 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKILP12757 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKILP12757 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKILP12757 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKILP12757 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKILP12757 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKILP12757 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SKILP12757 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKILP12757 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKILP12757 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKILP12757 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKILP12757 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKILP12757 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKILP12757 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKILP12757 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SKILP12757 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKILP12757 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKILP12757 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKILP12757 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKILP12757 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SKILP12757 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKILP12757 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKILP12757 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKILP12757 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms