Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GZMAP12544 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GZMAP12544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GZMAP12544 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GZMAP12544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GZMAP12544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GZMAP12544 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GZMAP12544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GZMAP12544 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GZMAP12544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GZMAP12544 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GZMAP12544 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GZMAP12544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GZMAP12544 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GZMAP12544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GZMAP12544 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GZMAP12544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GZMAP12544 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GZMAP12544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GZMAP12544 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GZMAP12544 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GZMAP12544 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GZMAP12544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GZMAP12544 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GZMAP12544 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GZMAP12544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GZMAP12544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GZMAP12544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GZMAP12544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GZMAP12544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GZMAP12544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GZMAP12544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GZMAP12544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GZMAP12544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GZMAP12544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GZMAP12544 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GZMAP12544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GZMAP12544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GZMAP12544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GZMAP12544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GZMAP12544 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GZMAP12544 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GZMAP12544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GZMAP12544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GZMAP12544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GZMAP12544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GZMAP12544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GZMAP12544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GZMAP12544 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GZMAP12544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GZMAP12544 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GZMAP12544 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GZMAP12544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GZMAP12544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GZMAP12544 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GZMAP12544 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GZMAP12544 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GZMAP12544 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GZMAP12544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GZMAP12544 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GZMAP12544 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GZMAP12544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GZMAP12544 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GZMAP12544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GZMAP12544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GZMAP12544 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GZMAP12544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GZMAP12544 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GZMAP12544 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GZMAP12544 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GZMAP12544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GZMAP12544 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GZMAP12544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GZMAP12544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GZMAP12544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GZMAP12544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GZMAP12544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GZMAP12544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GZMAP12544 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GZMAP12544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GZMAP12544 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GZMAP12544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GZMAP12544 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GZMAP12544 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms