Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHGAP10645 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHGAP10645 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHGAP10645 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHGAP10645 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHGAP10645 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHGAP10645 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHGAP10645 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHGAP10645 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHGAP10645 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHGAP10645 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CHGAP10645 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHGAP10645 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CHGAP10645 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHGAP10645 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHGAP10645 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHGAP10645 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHGAP10645 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHGAP10645 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CHGAP10645 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHGAP10645 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHGAP10645 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
CHGAP10645 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CHGAP10645 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CHGAP10645 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHGAP10645 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHGAP10645 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHGAP10645 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHGAP10645 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHGAP10645 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CHGAP10645 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHGAP10645 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHGAP10645 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CHGAP10645 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHGAP10645 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CHGAP10645 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHGAP10645 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHGAP10645 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHGAP10645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CHGAP10645 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHGAP10645 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CHGAP10645 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHGAP10645 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHGAP10645 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHGAP10645 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHGAP10645 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CHGAP10645 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CHGAP10645 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CHGAP10645 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHGAP10645 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHGAP10645 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CHGAP10645 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHGAP10645 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHGAP10645 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHGAP10645 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CHGAP10645 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHGAP10645 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CHGAP10645 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHGAP10645 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHGAP10645 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHGAP10645 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CHGAP10645 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHGAP10645 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHGAP10645 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CHGAP10645 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHGAP10645 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHGAP10645 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHGAP10645 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHGAP10645 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHGAP10645 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHGAP10645 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CHGAP10645 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHGAP10645 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CHGAP10645 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHGAP10645 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHGAP10645 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHGAP10645 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CHGAP10645 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHGAP10645 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHGAP10645 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CHGAP10645 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHGAP10645 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHGAP10645 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHGAP10645 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHGAP10645 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CHGAP10645 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CHGAP10645 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHGAP10645 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHGAP10645 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHGAP10645 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CHGAP10645 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CHGAP10645 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHGAP10645 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHGAP10645 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHGAP10645 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CHGAP10645 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CHGAP10645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHGAP10645 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CHGAP10645 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHGAP10645 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms