Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf88P0DMB2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf88P0DMB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf88P0DMB2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf88P0DMB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf88P0DMB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms