Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM49P0CI25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM49P0CI25 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM49P0CI25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM49P0CI25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM49P0CI25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM49P0CI25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms