Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBBP0CG47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBBP0CG47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBBP0CG47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBBP0CG47 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms