Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C4AP0C0L4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
C4AP0C0L4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
C4AP0C0L4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
C4AP0C0L4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C4AP0C0L4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C4AP0C0L4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
C4AP0C0L4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
C4AP0C0L4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
C4AP0C0L4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
C4AP0C0L4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms