Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1P09603 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1P09603 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1P09603 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1P09603 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1P09603 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1P09603 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1P09603 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1P09603 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1P09603 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1P09603 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1P09603 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1P09603 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1P09603 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1P09603 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1P09603 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1P09603 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1P09603 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1P09603 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1P09603 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1P09603 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1P09603 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1P09603 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSF1P09603 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1P09603 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1P09603 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1P09603 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1P09603 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSF1P09603 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1P09603 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1P09603 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1P09603 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSF1P09603 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1P09603 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSF1P09603 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1P09603 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1P09603 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1P09603 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSF1P09603 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1P09603 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1P09603 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF1P09603 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF1P09603 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1P09603 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1P09603 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF1P09603 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1P09603 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1P09603 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1P09603 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF1P09603 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF1P09603 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF1P09603 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF1P09603 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1P09603 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1P09603 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1P09603 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF1P09603 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF1P09603 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF1P09603 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1P09603 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1P09603 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1P09603 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF1P09603 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF1P09603 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF1P09603 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 448.7 ms