Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC2P02655 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOC2P02655 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOC2P02655 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APOC2P02655 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOC2P02655 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOC2P02655 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOC2P02655 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOC2P02655 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOC2P02655 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOC2P02655 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOC2P02655 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOC2P02655 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOC2P02655 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOC2P02655 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOC2P02655 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOC2P02655 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOC2P02655 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOC2P02655 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APOC2P02655 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOC2P02655 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOC2P02655 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOC2P02655 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOC2P02655 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOC2P02655 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOC2P02655 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOC2P02655 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOC2P02655 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOC2P02655 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOC2P02655 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOC2P02655 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOC2P02655 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APOC2P02655 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOC2P02655 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOC2P02655 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOC2P02655 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOC2P02655 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOC2P02655 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOC2P02655 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOC2P02655 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOC2P02655 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOC2P02655 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOC2P02655 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOC2P02655 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOC2P02655 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOC2P02655 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOC2P02655 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOC2P02655 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOC2P02655 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOC2P02655 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOC2P02655 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOC2P02655 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOC2P02655 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOC2P02655 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOC2P02655 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOC2P02655 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOC2P02655 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOC2P02655 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOC2P02655 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC2P02655 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC2P02655 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOC2P02655 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOC2P02655 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOC2P02655 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOC2P02655 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOC2P02655 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOC2P02655 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOC2P02655 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOC2P02655 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOC2P02655 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOC2P02655 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOC2P02655 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APOC2P02655 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOC2P02655 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APOC2P02655 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
APOC2P02655 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOC2P02655 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APOC2P02655 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOC2P02655 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOC2P02655 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOC2P02655 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APOC2P02655 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOC2P02655 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOC2P02655 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOC2P02655 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOC2P02655 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APOC2P02655 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APOC2P02655 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APOC2P02655 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOC2P02655 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms