Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
POLR1AO95602 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
POLR1AO95602 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
POLR1AO95602 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
POLR1AO95602 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
POLR1AO95602 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
POLR1AO95602 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
POLR1AO95602 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms