Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF3JO75822 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF3JO75822 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3JO75822 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EIF3JO75822 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3JO75822 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EIF3JO75822 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms