Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1O75570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTRF1O75570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRF1O75570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1O75570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms