Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC4O75487 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC4O75487 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC4O75487 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC4O75487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC4O75487 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC4O75487 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC4O75487 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC4O75487 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC4O75487 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC4O75487 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC4O75487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC4O75487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC4O75487 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC4O75487 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC4O75487 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC4O75487 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC4O75487 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC4O75487 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC4O75487 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC4O75487 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC4O75487 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC4O75487 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC4O75487 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC4O75487 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC4O75487 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC4O75487 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC4O75487 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC4O75487 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC4O75487 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC4O75487 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC4O75487 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC4O75487 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC4O75487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC4O75487 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC4O75487 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC4O75487 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC4O75487 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC4O75487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC4O75487 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC4O75487 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC4O75487 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC4O75487 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC4O75487 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC4O75487 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC4O75487 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC4O75487 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC4O75487 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC4O75487 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC4O75487 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC4O75487 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC4O75487 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC4O75487 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC4O75487 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC4O75487 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC4O75487 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC4O75487 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC4O75487 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC4O75487 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC4O75487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC4O75487 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC4O75487 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC4O75487 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC4O75487 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC4O75487 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC4O75487 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC4O75487 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC4O75487 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC4O75487 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC4O75487 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms