Protein–RNA interactions for Protein: O60906

SMPD2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2O60906 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPD2O60906 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD2O60906 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD2O60906 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD2O60906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPD2O60906 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms