Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF4O60810 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF4O60810 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF4O60810 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF4O60810 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAMEF4O60810 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms