Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCRIPO60506 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCRIPO60506 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNCRIPO60506 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNCRIPO60506 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNCRIPO60506 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNCRIPO60506 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms