Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms