Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC8O43402 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC8O43402 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC8O43402 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC8O43402 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC8O43402 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC8O43402 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMC8O43402 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC8O43402 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC8O43402 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC8O43402 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC8O43402 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC8O43402 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC8O43402 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC8O43402 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC8O43402 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC8O43402 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC8O43402 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC8O43402 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC8O43402 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC8O43402 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC8O43402 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC8O43402 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC8O43402 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC8O43402 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC8O43402 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC8O43402 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC8O43402 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC8O43402 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC8O43402 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC8O43402 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC8O43402 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC8O43402 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC8O43402 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC8O43402 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC8O43402 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC8O43402 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC8O43402 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC8O43402 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC8O43402 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC8O43402 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EMC8O43402 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC8O43402 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC8O43402 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC8O43402 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC8O43402 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC8O43402 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC8O43402 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC8O43402 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC8O43402 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC8O43402 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC8O43402 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC8O43402 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC8O43402 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC8O43402 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC8O43402 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC8O43402 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC8O43402 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC8O43402 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC8O43402 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMC8O43402 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
EMC8O43402 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC8O43402 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC8O43402 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC8O43402 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC8O43402 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC8O43402 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC8O43402 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC8O43402 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC8O43402 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC8O43402 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC8O43402 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC8O43402 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC8O43402 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC8O43402 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC8O43402 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC8O43402 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC8O43402 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC8O43402 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms