Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRTM2O43300 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRTM2O43300 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRTM2O43300 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRTM2O43300 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRTM2O43300 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms