Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNPHO15079 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNPHO15079 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNPHO15079 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNPHO15079 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNPHO15079 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNPHO15079 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNPHO15079 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNPHO15079 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNPHO15079 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNPHO15079 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNPHO15079 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNPHO15079 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNPHO15079 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNPHO15079 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNPHO15079 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNPHO15079 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNPHO15079 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNPHO15079 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNPHO15079 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNPHO15079 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNPHO15079 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNPHO15079 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNPHO15079 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNPHO15079 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNPHO15079 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNPHO15079 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNPHO15079 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNPHO15079 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNPHO15079 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNPHO15079 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNPHO15079 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNPHO15079 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms