Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GIPC1O14908 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GIPC1O14908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GIPC1O14908 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GIPC1O14908 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms