Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAFD1O14545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAFD1O14545 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAFD1O14545 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAFD1O14545 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAFD1O14545 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAFD1O14545 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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