Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP2O00295 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP2O00295 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP2O00295 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP2O00295 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP2O00295 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP2O00295 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP2O00295 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP2O00295 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP2O00295 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP2O00295 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP2O00295 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP2O00295 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP2O00295 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP2O00295 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP2O00295 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP2O00295 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP2O00295 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP2O00295 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP2O00295 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP2O00295 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP2O00295 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP2O00295 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP2O00295 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP2O00295 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP2O00295 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP2O00295 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP2O00295 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP2O00295 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP2O00295 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP2O00295 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP2O00295 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP2O00295 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP2O00295 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP2O00295 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP2O00295 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP2O00295 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP2O00295 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP2O00295 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TULP2O00295 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP2O00295 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP2O00295 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP2O00295 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP2O00295 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TULP2O00295 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP2O00295 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP2O00295 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP2O00295 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP2O00295 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP2O00295 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP2O00295 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP2O00295 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP2O00295 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP2O00295 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP2O00295 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP2O00295 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP2O00295 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP2O00295 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP2O00295 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP2O00295 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP2O00295 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP2O00295 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TULP2O00295 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP2O00295 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP2O00295 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP2O00295 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP2O00295 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP2O00295 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP2O00295 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP2O00295 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP2O00295 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP2O00295 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP2O00295 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP2O00295 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP2O00295 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP2O00295 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP2O00295 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP2O00295 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP2O00295 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP2O00295 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP2O00295 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP2O00295 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TULP2O00295 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP2O00295 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP2O00295 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP2O00295 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP2O00295 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TULP2O00295 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TULP2O00295 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms