Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF103O00237 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF103O00237 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF103O00237 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF103O00237 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF103O00237 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF103O00237 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF103O00237 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF103O00237 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF103O00237 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF103O00237 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF103O00237 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF103O00237 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF103O00237 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF103O00237 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF103O00237 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF103O00237 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF103O00237 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF103O00237 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF103O00237 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF103O00237 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF103O00237 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF103O00237 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF103O00237 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF103O00237 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF103O00237 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF103O00237 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF103O00237 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF103O00237 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF103O00237 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF103O00237 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF103O00237 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF103O00237 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF103O00237 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF103O00237 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF103O00237 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF103O00237 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF103O00237 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF103O00237 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF103O00237 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF103O00237 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF103O00237 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF103O00237 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF103O00237 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF103O00237 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF103O00237 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF103O00237 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF103O00237 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF103O00237 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF103O00237 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF103O00237 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF103O00237 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF103O00237 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF103O00237 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF103O00237 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF103O00237 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF103O00237 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF103O00237 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF103O00237 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF103O00237 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF103O00237 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF103O00237 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF103O00237 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF103O00237 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF103O00237 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF103O00237 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF103O00237 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF103O00237 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF103O00237 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF103O00237 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF103O00237 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF103O00237 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF103O00237 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF103O00237 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF103O00237 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms